课程简介

Imaris在神经领域的应用

2D脑片配准及信号识别

使用Fiji将脑片和图谱进行配准，巧妙使用Cell模型对脑区进行分割，使用Spot对信号进行识别统计。

3D全脑配准

使用Imaris准确的信号识别 (Spot， Surface血管)，将识别的信号载入到标准脑中，便于展示信号的相对空间位置以及比较不同组别的信号分布。

胶质细胞的识别，统计参数的介绍

使用Filament，对microglia的process进行识别，重构后的模型可以得到 Number of branch\ sholl of intersection\convex hull\ the ratio of soma volume and convex hull volume等统计量。

重构后的Filament—create channel，相较于单一阈值分割（threshold）可以更加准确的提取胶质细胞的形态，该步对于后期计算细胞motility是一个很不错的mask方法。

提取细胞的ROI，计算膜和质的平均荧光强度

利用Imaris9.9更新的Labkit，对细胞膜、细胞质、细胞核的区域分割，使用建立好的通道进行模型重构，计算其平均荧光强度的变化。

Vantage

使用Vantage功能，直观展示目标的形态对比, 统计量多维度的展示，将统计量反映在颜色、大小等信息层面。

课程安排

Imaris在神经领域的应用

时间：2022年4月20日(周三)14:00-15:00

课程题目：Imaris在神经领域的应用

主讲人：高辛未-光学影像中心工程师

主讲人介绍

高辛未 光学影像中心工程师

北京脑科学与类脑研究中心

毕业于北京工业大学生物医学工程系。现任北京脑科学与类脑研究中心影像平台工程师，主要负责平台激光共聚焦、双光子、转盘共聚焦、光片显微镜等仪器的培训；同时负责平台数据分析工作，擅长2D、3D数据配准及信号识别，数据重构，细胞钙信号活动定量分析，细胞间钙波的传播速度计算、时间序列的位移校正等。在成像及数据分析及应用方面都具有深刻理解和丰富经验。

点击此处报名预约课程

欢迎关注牛津仪器

The Business of Science

400 678 0609 | www.oxinst.cn