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云学院 | 空间转录组:Split-FISH技术及其在复杂组织内的多重RNA成像

本次报告中,来自Genome Institute of Singapore的Chen Kok Hao博士将针对空间转录组学这一热门研究领域进行详细介绍。2015年Chen Kok Hao博士在哈佛大学Zhuang Xiaowei课题组开发了细胞内原位多重RNA成像的方法(MERFISH),文章发表在顶级杂志Science上(Science ,348, aaa6090 (2015))。为解决组织中RNA成像非特异性背景噪音,Chen Kok Hao博士将在本次报告中介绍他们课题组最新开发的新型Split-FISH技术(Nature Method, 2020)。

Split-FISH技术通过split探针的设计和优化,减少了杂交脱靶背景信号,大大降低了非透明化组织中的假阳性信号,实现更精确的RNA分析。通过量化单个细胞中317基因的分布和丰度,揭示了Split-FISH技术在各种小鼠组织中的有效性,并揭示了多种复杂组织中转录组空间调控方式。

Chen实验室使用了Andor背照式sCMOS相机Sona 4.2B-11对多种复杂组织进行成像,借助于此款相机的高灵敏,成像速度和市场上最大的成像视野的特性,完成了多重FISH和多种RNA共定位相关研究。

本次课程中,您将学到:

  • 多重FISH非常适合于空间转录组的研究
  • Split-FISH在降低RNA成像中背景噪音和假阳性信号上的优势
  • RNA定位分析在多种小鼠器官中的应用实例
  • 背照式EMCCD iXon和sCMOS Sona系列相机的特点及应用范围

主讲人:Chen Kok Hao 研究员

Genome institute of Singapore新加坡基因组研究所

时间:2021年4月22日14:00-15:00 BJS

会议平台:腾讯会议

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注意事项:

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  • 本期讲座将在腾讯会议开设,请下载客户端(PC和手机均可)参与讲座与讲师互动沟通。
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位置

线上讲座

日期

2021/04/22

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